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白酒窖泥细菌群分析

返回列表 来源:未知 发布日期:2020-04-07 09:34【

1 材料与方法


窖泥样品:取自川南某白酒厂3个同期建造车间中的 9口窖池,且窖池连续生产10年以上,取样部位为每口窖底 中心部位,取得窖泥样品后将其编号为1~9,其中1~3、 4~6、8~9为分别同一车间不同窖池窖泥。DK-S28恒温水浴锅:上海一恒科学仪器有限公司; SORVALL Stratos高速冷冻离心机、Thermo 900超低温冰箱: 美国Thermo Scientific公司;TGL-16G台式高速离心机:上海实验仪器厂有限公司;Minisubcell水平电泳仪、GelDoc 2000凝胶成像系统、MyCycler PCR仪:美国Bio-Rad公司;D-160均质机:美国Scilogex公司;GS junior高通量测序仪: 美国Roche公司;Cary Eclipse荧光分光光度计:安捷伦科技 (中国)有限公司。


2 结果与分析


以9个窖泥样品的DNA为模板,采用带有特殊标签的 引物进行PCR扩增,PCR扩增产物经纯化后,以其为模板进 行emPCR扩增,emPCR扩增产物碱基长度在450 bp左右。 采用高通量测序技术对emPCR扩增产物进行测序,通过标 签信息区分不同样品。本次测序共获得298 405条序列,序 列碱基平均长度为321 bp,大部分序列的碱基长度集中在450 bp左右,序列碱基长度与实验设计碱基长度基本一致。经过Cope V1.2.3.3 软件筛选过滤掉低质量序列和重复序列,最终获得有效序 列66 322条,有效序列的碱基长度在450 bp左右。


3 结论 


主要通过高通量测序法分析了浓香型白酒不 同窖泥样品中的细菌群落结构。通过高通量测序共获得 66 322条有效序列,2 050个OTU。其中窖泥样品1、2、3平均 获得351个OTU,窖泥样品4、5、6平均获得214个OTU,窖泥 样品7、8、9平均获得153个OTU。根据OTU,9个不同窖泥 样品中共分为9个门类,其中窖泥样品1、2、3中共有6个门 类,窖泥样品4、5、6中共有9个门类,窖泥样品7、8、9中共有 8个门类。






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