材料与方法
LX-100 手掌型离心机(江苏海林市其林贝尔仪器制造有限公司);2-16PK 型高速台式离心机(SIG- MA 公司);PCR 仪(TaKaRa);YP202N 电子天平(上 海精密科学仪器有限公司);DYY-6C 型电泳仪(北京 市六一仪器厂);微波炉(青岛海尔制品有限公司)电 泳槽(北京君意东方电泳设备有限公司);Hws24 电热 恒温水浴锅 (上海一恒仪器有限公司)Gel Doc 2 000 紫外凝胶成像分析系统(美国 Bio-RAD)。Ex Taq DNA 聚合酶、Ex Taq Buffer、DNA Marker (2 000)、DNA 提取试剂盒 (TIANamp Genomic DNA Kit)、超净水、引物、核酸电泳缓冲液(TAE)、6×Load- ing Buffer、琼脂糖(AGAROSE G-10)、dNTP Mixture、 溴化乙锭(EB)。
结果
目前用于构建系统发育树的基因,以线粒体 pcox1 和核糖体 ITS1、ITS2 基因应用最为广泛。其 中,在使用 pcox1 基因作为分子标记时范围没有核糖 体 ITS1、ITS2 基因那么广。pcox1 和 ITS 都拥有高度 的保守性,但 pcox1 基因的特点为种内分化弱,种间 分化强,而 rDNA 序列功能上具有进化时钟性,目前 已经被应用到物种分类与进化分析中,尤其是种间 的分类。ITS 进化快,物种内发生变异的几率小, 物种间发生变异的几率大。通过分析 ITS 序列可以 构建进化树并分析其亲缘关系。但是实验由于基因 库中没有片形褶皱绦虫的 pcox1 基因,所以用 pcox1 作为目的基因只鉴定了该未知虫体的属,而无法确 定鉴定该绦虫具体是什么,而基因库中有片形褶皱 绦虫 ITS 的序列,所以我们可以确切的证明未知绦虫 为片形褶皱绦虫。
免责声明:文章仅供学习和交流,如涉及作品版权问题需要我方删除,请联系我们,我们会在第一时间进行处理。